在进行原位修复时，施加的生物表面活性剂还可能会被吸附到土壤上，其也可能影响土壤的物理、化学和生物性质。生物表面活性剂的存在会减少土壤－水界面的表面张力，引起土壤孔隙内压降的变化，从而造成水和空气在土壤孔隙间分配的变化，改变土壤原有的物理性质和氧化还原条件，产生潜在的负面影响。有关表面活性剂与土壤环境相互作用的研究非常缺乏，但这是非常值得关注和深入研究的。
枯草菌表面活性剂是一种有效的生物表面活性剂，但与前面2生物表面活性剂相比，目前有关其在生物降解修复中的应用研究较少。
Awashti等首次探讨了枯草菌表面活性剂（Surfactin）对杀虫剂硫丹生物降解的促进作用。Olivera等从污染底泥中分离出一种细菌subtilis O9，其在以蔗糖为底物时，能分泌出枯草菌表面活性剂。他们将枯草菌表面活性剂加入污染底泥中，10d后发现，仅有6.8％的脂肪烃和7.2％芳香烃未被降解。
1）生物表面活性剂是一种公认的多功能的、性能优异的处理剂，具有生物降解和低度毒性等特点，在环境修复等方面应用前景广泛。但迄今为止，由于生产成本较高，尚无法与市场上人工合成的化学产品相抗衡，这也影响了其广泛应用，必须改进微生物表面活性剂的生产工艺，提高产出率，降低生产成本。
2）某些生物表面活性剂增溶、促进有机污染物降解能力有限，这也在一定程度上限制了生物表面活性剂的发展。但随着微生物技术的高速发展，改良菌株成为可能。因此可以采取基因工程等新技术，改良菌株，生产更有效的表面活性剂。
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